醫用棉簽：在制造時有十分嚴格的要求，一般選用醫用脫脂棉和竹棒制成，根據標準制成，一旦達不到標準就不得上市；一般棉簽：一般選用一般的棉花、海綿頭或者是布頭制成。
等級不同：醫用棉簽：由于醫用棉簽基本上用于處理創傷，所以關于產品質量要求較高，有必要是滅菌等級的產品，拆開即可運用；一般棉簽：一般對錯滅菌產品，能夠用于化妝，畫面等非無菌要求運用。
用處不同：醫用棉簽：主要用于創傷處理，要求產品無菌，對人體和皮膚或者是機體沒有刺激性，且要求有較強的吸水性；一般棉簽：用處廣泛，且制造成本低，但不能用于處理創傷。
貯存條件不同：醫用棉簽：由于用處局限性較大，為了避免運用時出現問題，所以要求有必要保存在無腐蝕性且通風，并且還不能高溫，相對濕度不能超過80%;一般棉簽：基本沒什么要求，只要是防塵防水即可。
